2203年，人類科技高度進步，他們耗時百年研發(fā)出一種能夠從地面向下高強度挖掘的巨大動力鉆井，將其命名為“上帝之手”并啟動了“地下3000英里”計劃，因此破壞了地球引力誘發(fā)了極端氣候。在挖掘途中，發(fā)現了一種從未被探測出的新型礦物晶體，此晶體中含有強輻射，可誘使人基因發(fā)生異變，遂被列為特級保護資源，安置在重點科研實驗基地內，并將其命名為——S’ie。

與此同時，一種外星噬菌突然來襲，它們受S’ie吸引，短短八年內不斷地吞噬著地球上的生命體。這種外星噬菌破壞了人類社會，各地勢力接連倒臺，由儲藏大量S’ie的地區(qū)的科研人員們自發(fā)組成臨時政權，并迅速劃分出十一個無菌區(qū)。

八年后，生存在十一區(qū)內的高中二級生少年阿燦，他因一些兒時的意外對“上帝之手”十分的痛恨，更不愿接受學校對十一區(qū)的狂熱吹捧，于是他整日逃避學校自我拋棄，卻在一次夜晚意外遇到被追擊的神秘少女朧。

與朧的相遇徹底改變了燦的人生，那場意外使他發(fā)現了自己身上隱藏著強大到足以改變世界的力量，從此他被卷入了這場來自狂熱科技與人類本性的戰(zhàn)爭...